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《自然》公開迄今最大規(guī)模的人類遺傳變異體目錄

科技日報 | 2020-06-01 09:32:27

英國《自然》《自然·通訊》《自然·醫(yī)學(xué)》雜志近日同時發(fā)表來自多家研究機構(gòu)的一系列報告,集中描述了對一個匯集了逾14萬人樣本的數(shù)據(jù)庫——基因組聚集數(shù)據(jù)庫(gnomAD)的應(yīng)用,該數(shù)據(jù)庫擁有迄今最大規(guī)模的人類遺傳變異體公開目錄,是我們深入認識人類基因功能、發(fā)現(xiàn)新疾病相關(guān)基因的寶貴資源。

人類基因組中絕大多數(shù)基因的功能依然未知。揭示基因功能的一種方法是觀察基因發(fā)生突變后的結(jié)果。這些變異體往往會產(chǎn)生不良結(jié)果,但通常較為罕見。大規(guī)?;驕y序研究有助于考察這些功能喪失型變異體的效應(yīng),或能帶來對人類生物學(xué)特征和疾病的重要見解。

此次《自然》發(fā)表的一篇概述性報告中,美國麻省理工學(xué)院—哈佛大學(xué)博德研究所科學(xué)家康拉德·卡澤維斯基及其同事,描述了從125748個全外顯子組和15708個全基因組測序數(shù)據(jù)集中鑒定出的443769個預(yù)測的功能喪失型變異體。鑒于這些變異體預(yù)計會影響其編碼蛋白的正常運作,團隊進而評估了這些變異體對生理機能的影響:究竟是幾乎沒有影響,還是會導(dǎo)致嚴重的健康問題。《自然》同時發(fā)表的另外兩篇報告,利用該數(shù)據(jù)庫創(chuàng)建了一個結(jié)構(gòu)性變異體資源庫,并評估了基因缺失、復(fù)制,甚至是顛倒方向所產(chǎn)生的影響。

同時出爐的其他報告,探討了如何利用人類功能喪失型變異體評價候選藥物靶點,提升對遺傳變異體的臨床解讀,以及如何更詳細地考察特異性功能喪失型變異體。譬如英國帝國理工學(xué)院科學(xué)家尼古拉·威芬和同事分析了與帕金森病風(fēng)險增加相關(guān)的一個基因的變異體,結(jié)果顯示靶向這個基因或是一種安全的治療方法。

科學(xué)家們表示,gnomAD項目的樣本量是其前任的兩倍多,之前的外顯子組聚集聯(lián)盟(ExAC)收錄了6萬多個外顯子組數(shù)據(jù)??删S斯基與同事也指出,他們距離鑒定出人類全部的預(yù)測功能喪失型變異體還很遙遠,盡管如此,他們認為這項資源能夠提升我們對罕見和常見遺傳病的評估。

總編輯圈點

生物學(xué)和醫(yī)學(xué)的發(fā)展,已經(jīng)使科學(xué)家對很多疾病的研究直抵分子和基因?qū)用妗I钊胙芯咳祟惢蚪M,成為解鎖諸多重大疾病病因的關(guān)鍵,帕金森癥、阿爾茲海默癥、自閉癥等一系列病因復(fù)雜的疾病都在此列。除了尋找病因,對人類基因組的破譯,也可以為很多疾病的治療定位重要藥物靶點,從而為研發(fā)更有效的生物藥物、制定更精準的診療方案帶來希望。

  • 標簽:人類遺傳變異體,目錄

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